Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spire1Q52KF3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms