Protein–RNA interactions for Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88bQ4QRL3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms