Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms