Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms