Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa20Q45VN2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms