Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms