Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ckap2Q3V1H1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms