Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms