Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prdm6Q3UZD5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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