Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc160Q3UYG1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc160Q3UYG1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc160Q3UYG1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc160Q3UYG1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc160Q3UYG1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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