Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms