Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms