Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn4Q3UV66 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms