Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr1d1Q3UV55 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms