Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms