Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms