Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms