Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms