Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms