Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc33Q3ULW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms