Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms