Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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