Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garem1Q3UFT3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms