Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Cops9Q3U898 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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