Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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