Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms