Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec24aQ3U2P1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms