Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms