Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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