Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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