Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q3U1D9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q3U1D9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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