Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arid5aQ3U108 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms