Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms