Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a5Q3TYU2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms