Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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