Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms