Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Shcbp1lQ3TTP0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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