Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxw18Q3TSA9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxw18Q3TSA9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms