Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afvQ3THW5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms