Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Treml4Q3LRV9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Treml4Q3LRV9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Treml4Q3LRV9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Treml4Q3LRV9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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