Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd300lgQ1ERP8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms