Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo3bQ1EG27 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo3bQ1EG27 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms