Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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