Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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