Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itgb8Q0VBD0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms