Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms