Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms