Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms