Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms