Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms